É no âmbito da Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa que se elabora, discute e articula a política de pós-graduação lato e stricto sensu da PUC Goiás, e que se fomenta a pesquisa científica na universidade. Propõe diretrizes para os projetos pedagógicos das Escolas e dos cursos de pós-graduação, articula a integração com o ensino da graduação.

Suas atribuições ainda incluem o incentivo à inovação científica, sua aplicação tecnológica e a socialização do conhecimento, criando condições favoráveis à investigação e divulgação do saber nas diversas áreas de conhecimento, e a socialização dos resultados das pesquisas e da produção científico-cultural.